Наступний крок – прототипування, за допомогою якого можна зрозуміти функціональний каркас сайту і помацати його. Також на прототипі сайту видно розташування елементів. Звичайно прототип не догма і дизайнер при малюванні дизайну може модифікувати вид, місце розташування, черговість елементів, але основна логіка і суть залишається ясною при його вивченні.